O Dr. Gonçalves obteve a licenciatura em Biologia Marinha e Biotecnologia em 2006, o mestrado em Aquacultura, a pós-graduação em Ciências Farmacêuticas pela Universidade do Algarve (Portugal) e o doutoramento na Universidade de Stirling, estudando o impacto da Micotoxinas na aquicultura. Em 2006, Rui iniciou a sua carreira trabalhando num dos maiores incubatórios de douradas e robalos da Europa, onde foi responsável pela criação e desmame de larvas. Posteriormente, concentrou o seu trabalho na nutrição e saúde das espécies aquáticas na Universidade do Algarve. Em 2014, após um período de trabalho na Noruega num incubatório de ouriços-do-mar, Rui juntou-se à BIOMIN Holding, tendo trabalhado como cientista de aquicultura no Departamento de Desenvolvimento de Micotoxinas.

Dr. Gonçalves é autor e co-autor de mais de 50 artigos em revistas internacionais com revisão por pares, e liderou a publicação do livro intitulado "Micotoxinas na Aquicultura", onde também foi autor de vários capítulos.